ประเด็นความเสี่ยงที่สรรพากรอาจเพ่งเล็ง ซึ่งผู้ประกอบการควรให้ความระมัดระวัง ได้แก่
1.ไม่มีบัญชีเงินฝากธนาคาร รายการซื้อ-ขายทุกรายการเป็นเงินสด
2.มีขาดทุนข้างต้น หรือกล่าวคือ อัตรากำไรขั้นต้นติดลบ
3.สินค้าคงเหลือไม่สอดคล้องกับยอดขาย สต๊อกสินค้าไว้สูงกว่ายอดขายในแต่ละปี
4.รายได้ที่ยื่น ภงด.50 น้อยกว่ารายได้ที่ยื่นภาษีถูกหัก ณ ที่จ่าย
5.ไม่มีสินทรัพย์ หรือ มีมากผิดปกติ
6.มีเงินกู้ยืมกรรมการ หรือ เงินให้กรรมการกู้ยืมมากผิดปกติ
7.บัญชีค่าใช้จ่ายค้างจ่าย ค้างนานผิดปกติ
8.ขาดทุนสะสมเกินทุนรับชำระ
9. มีคนงานเพิ่ม แต่รายได้ลด